吴敬琏研究员的主要研究与教学领域为理论经济学、比较制度分析、中国经济改革的理论和政策等。他的主要代表作有《现代公司与企业改革》、《十年纷纭话股市》等。
 
吴敬琏推荐书目为：
   
 一、经济学
   
    1.《经济学原理》（Principles of Economics，byN.Gregory Mankiw；曼昆，三联书店、北京大学出版社，1999年版）
    2.《经济学》（Economics，by Joseph E.Stiglitz；斯蒂格利茨，中国人民大学出版社，1997年版）
    3.天津国企招聘信息网《比较制度分析》（青木昌彦，上海远东出版社，2001年版）
   
二、国企改革和企业制度
   
    4.《国企改革攻坚15题》（陈清泰、吴敬琏等，中国经济出版社，1999年版）
    5.《现代公司与企业改革》（吴敬琏，天津人民出版社，1994年版）
    6.《公司法则）》（Corporate Law，by Robert C.Clark；罗伯特·克拉克，工商出版社，1999年版）
    7.Economics，Organization，and Management，by Milgrom，P.And J.Roberts，New Jersey：Pentice Hall 1992.
    8.《董事会：如何应付错综复杂的经济社会》（埃达·登勃、F·弗里德里克·纽鲍尔，新华出版社，1996年版）
   
三、政府作用
   
    9.《制高点：重建现代世界的政府与市场之争》（丹尼尔·耶金、约瑟夫·斯坦尼斯罗，外文出版社，2000年版）
   
 四、高新技术产业
   
    10.《信息规则：网络经济的策略指导》（卡尔·夏皮罗、哈尔·瓦里安，中国人民大学出版社，2000年版）
    11.《硅谷优势》（《地区优势：硅谷和128公路地区的文化与竞争》，安纳利·萨克森宁，上海远东出版社，1999年版）
    12.《走出误区：经济学家论说硅谷模式》（钱颖一、肖梦编，中国经济出版社，2000年版）
   
 五、股市
   
    13.《非理性繁荣》（罗伯特·希勒，中国人民大学出版社，2001年4月版）
   
六、推荐文章
    14.《公司董事和经理的法律责任》（李波）
    15.《控股公司和集团公司》（李波）
    16.《警惕滑入坏的市场经济》（钱颖一）
    17.《从纳斯达克股票市场看我国二板市场》（李波）
    18.《加入世贸组织后中国金融的稳定与发展》（钱颖一、黄海洲）
    19.《法、法治与宪政》（李波）
    20.《理解现代经济学》（钱颖一）